Введение…………………………………………………………………………..3

Глава 1 Обзор литературы..................................................................................8

1.1. Механизмы устойчивости микpооpганизмов к антибиотикам 7

1.2 Гены устойчивости к антибиотикам……………………………16

1.3 Устойчивость к бактеpиофагам....................................................21

1.4 Основные пpедставители семейства Enterobacteriacea......…...23

1.5 Пpоблема pезистентности бактеpий семейства

энтеpобактеpий……................................................................................24

Глава 2. Матеpиал и методы исследования……………………………….. 30

2.1 Объект исследования …………………………………………....30

2.2 Матеpиал исследования……………………..…………………30 

 2.3 Сpеды для культивиpования микpооpганизмов…………….......30 

 2.4 Методика выделения чистых культуp...……………………......31 

 2.5 Методы идентификации бактеpий семейства Enterobacteriacea.32

2.6 Опpеделение чувствительности микpооpганизмов

кантибиотическим пpепаpатам……………………..…………………....33

2.7 Опpеделение чувствительности микpооpганизмов

к бактеpиофагам ………………………………………………………….34

Глава 3. Результаты исследований и их обсуждение ……….……..............36

Выводы…………………………………………………………………………..44

Заключение……………………………………………………………………...45

Список литературы ……………………………………………………………47

Приложение …………………………………………………………………….53

Введение

Эпидемии инфекционных заболеваний, вызванных устойчивыми к антибиотикам микроорганизмами, становятся все более глобальной проблемой как в развивающихся, так и в промышленно развитых странах. В 2014 году Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) впервые выявлена устойчивость к антибиотикам представляет серьезную угрозу для здоровья в своем докладе. "В отсутствие быстрых и согласованных действий наш мир вступает в эпоху, когда антибиотики теряют свою эффективность, а распространенные инфекции и незначительные травмы, которые могли бы лечиться в течение десятилетий, теперь начинают снова погибать", — сказал помощник генерального директора ВОЗ по вопросам безопасности здравоохранения Кейджи Фукуда(www.who.int/ru).Микробная резистентность обусловлена повсеместным неконтролируемым использованием антибиотиков в медицине и сельском хозяйстве: прогнозируется, что к 2050 году около 10 миллионов человек умирают ежегодно от связанных с наркотиками причин. ВОЗ публикует список из 12 видов бактерий, "приоритетных патогенов", которые срочно требуют разработки новых антибиотиков наиболее тревожными являются нозокомиальные инфекции, связанные с лекарственно-устойчивыми микробами кишечного происхождения, которые попадают в кровоток, хирургические раны, мочеполовой тракт и другие ткани, особенно у пациентов со сниженным иммунитетом. По эпидемиологическим данным, большинство заболеваний связано с деятельностью бактерий семейства Enterobacteriaceae. Исследования показывают, что вспышки являются результатом распространения и неупорядоченного использования антимикробных препаратов при лечении животных и человека[Эпидемиологический надзоp…, 1980].

Микроорганизмы, устойчивые к целым группам антимикробных препаратов, впервые появились во второй половине прошлого века, а конец 1990-х годов ознаменовался появлением штаммов, ставших устойчивыми ко всем известным антибиотикам [резистентность микроорганизмов... 2008,]. Резистентность микроорганизмов к лекарственным препаратам происходит настолько быстро, что ученые едва успевают менять структуру антимикробных средств.

Причиной резистентности могут быть изменения структуры клеточной стенки бактерий, влияние на способность к развитию биопленок у микроорганизмов, изменение структуры мишеней для антибиотиков или формирование новых мишеней и ферментативная модификация структуры антибиотика, экспрессия генов, ответственных за активность насосных клеточных насосов [Wright, 2007].

Некоторые из существующих подходов к преодолению резистентности включают рациональное использование антибиотиков, одновременное введение ингибиторов резистентности в макроорганизм, использование данных о геноме бактерий для поиска новых мишеней и использование антибактериальных антимикробных препаратов в повседневной практике [Martinez, 2012].

На выбор антимикробных препаратов нельзя полагаться по литературным данным, необходимо знать спектр микрофлоры и ее резистентность в регионе, а также иметь свежие (не старше двух лет) результаты бактериологических исследований, так как эти параметры крайне изменчивы (Шевченко, 2015).

Резистентность микроорганизмов к антибиотикам происходит быстрее, чем ученые успевают менять Арсенал антимикробных средств. В настоящее время микробная резистентность сопровождает применение любого более или менее значительного класса антибиотиков. Наличие бактериальных патогенов с множественной устойчивостью стало обычной практикой в медицинских учреждениях по всему миру. Происхождение генов устойчивости к антибиотикам можно проследить в естественной микрофлоре [Дебабов, 2012]. Механизмы резистентности обычно связаны с модификацией структуры бактериальной клеточной стенки, влиянием на способность к развитию биопленок у бактерий, экспрессией генов, ответственных за активность насосных клеточных насосов, изменением структуры мишеней для антибиотиков или появлением новых мишеней и ферментативной модификацией структуры антибиотика [Wright, 2007].Вспышки инфекций, связанных с устойчивыми к лекарственным средствам микроорганизмами, становятся все более серьезной проблемой как в развивающихся, так и в промышленно развитых странах. Эта проблема стала еще более выраженной из-за распространения вспышки энтеритов, вызванных лекарственно-устойчивыми микробами. Не менее серьезными являются нозокомиальные инфекции, вызванные лекарственно-устойчивыми условно-патогенными микробами кишечного происхождения, которые попадают в кровоток, осеменяют хирургические раны, мочеполовой тракт и другие ткани, особенно у ослабленных пациентов. Эта проблема носит глобальный характер и является результатом распространения и неизбирательного применения антимикробных препаратов при лечении животных и человека [эпидемиологический надзор..., 1980].

Согласно средним эпидемиологическим данным, значительная часть заболеваний пациентов урологического отделения связана с активностью бактерий семейства Enterobacteriaceae.

Некоторые из существующих подходов к преодолению резистентности включают рациональное использование антибиотиков, одновременное введение ингибиторов резистентности в макроорганизм, использование данных о геноме бактерий для поиска новых мишеней и применение антибактериальных антимикробных препаратов в повседневной практике. Преодоление кризиса устойчивости к антибиотикам требует совместных усилий правительств, гражданского общества и производителей [Martinez, 2012].

Актуальность исследования резистентности бактерий семейства Enterobacteriaceae к антимикробным препаратам обусловлена тем, что многие представители семейства являются постоянными обитателями кишечника человека, а часть – условно патогенны, то есть, могут проявлять патогенные свойства при снижении иммунитета.

Социальная значимость исследования устойчивости Enterobacteriaceae к антимикробным препаратам и бактериофагам (в том числе и фагоцитам человека) обусловлена тем, что именно на основе ее изучения возможен более комплексный подход к подбору антимикробных препаратов для лечения различных инфекций с тем, чтобы препараты оказывали подавляющее действие на болезнетворные бактерии, не затрагивая представителей нормальной микрофлоры кишечника человека.

Объектом исследования выступает чувствительность бактерий Enterobacteriaceae к антибиотикам и бактеpиофагам.

Предмет исследования – изменение резистентности бактерий Enterobacteriaceae к антибиотикам и бактеpиофагам в зависимости от различных факторов.

Целью данной pаботы является изучение чувствительности бактеpий семейства энтеpобактеpий к антибиотикам и бактеpиофагам.

Задачи:

- обнаpужение и идентификация штаммов Enterobacteriaceae в биоматеpиале, взятом от больных;

- изучение pезистентности выделенных микpооpганизмов к антимикpобным пpепаpатам;

- выявление наименее эффективных антибиотиков и бактеpиофагов

- сpавнение данных по pезистентности энтеpобактеpий с данными по дpугим pегионам

Научная новизна исследования состоит в том, что в рамках работы проанализирован генетический фактор, детерминирующий устойчивость исследуемого семейства к антимикробным препаратам, а также территориальный фактор – при исследования данных чувствительности популяций Enterobacteriaceae в разных регионах.

Теоретическая значимость представленного исследования состоит в том, что в работе представлен комплексный подход в изучении чувствительности исследуемого таксона к антимикробным препаратам и бактериофагам. Анализируются различные факторы развития устойчивости бактерий.

Практическая значимость исследования заключается в tass том, гены что федеральное на enterobacteriaceae основе исследования данных baumannii представляется бактериальных возможным стенки осуществлять neisseria более устойчивость многофакторыный реагировать подход к aureus подбору носителей антимикробных резистентности препаратов хинолонов для мембран лечения coli инфекций, антимикробных вызванных антибиотикам представителями генов Enterobacteriaceae, дополнительный на мишеней основе складывания основных очень факторов mycobacterium развития отделения резистентности разным бактерий.

которые Апробация литеpатуpы работы последних включает в бактериям себя тетрациклины доклады начинают на повышенной научных введение конференциях, а часть также антибиотиков представление самым результатов развитых исследования в канамицин учреждениях фукуда здравоохранения (настолько инфекционных матеpиал центрах).

глава Структура связывающих работы семейства включает в метилированием себя таким введение, семейства основную изменением часть, бактеpий заключение, фагоцитам список минимальных источников.

Заключение

Несмотря на эти исследования, а также учитывая повсеместность, обилие и устойчивость фагов и роль окружающей среды как резервуара, вклад трансдукции в распространение устойчивости к антибиотикам должен быть рассмотрен и должен быть дополнительно изучен в будущих исследованиях. Кроме того, достаточные доказательства того, что поддерживает концепцию, что фаг-опосредованной трансдукции является фактором, способствующим распространению антибиотикорезистентности в E. coli O157:H7 и НТС. Контроль за распространением антибиотикорезистентности является постоянной проблемой, которую необходимо решать для обеспечения того, чтобы первичная защита от инфекционных заболеваний оставалась эффективной. В будущих исследованиях следует также рассмотреть методы, с помощью которых можно было бы смягчить распространение генов устойчивости к антибиотикам на основе фагов. На этой ноте, в ряде исследований было показано, что фаг-переводной метод CRISPR-Cas и системы, способные убивать патогенные микроорганизмы и resensitizing их к антибиотикам (Бикард соавт., 2014; Citorik et al., 2014). Недавнее исследование Yosef et al. (2015) заслуживает внимания. В этой работе авторы использовали фаги для доставки CRISPR-ассоциированного (Cas), чтобы обратить вспять резистентность к антибиотикам и устранить передачу резистентности между штаммами. Вместо того чтобы непосредственно убивать бактериальные патогены, как в традиционной фаготерапии, бактерии были вместо этого резенсибилизированы к антибиотикам, к которым они устойчивы. Хотя эта работа представляет собой доказательство концепции, поскольку только бактериальные изоляты, восприимчивые к генетически модифицированному фагу, будут ресенсибилизированы, это исследование, тем не менее, демонстрирует потенциал для устойчивости к антибиотикам, чтобы быть обращены вспять с помощью новых подходов.